《花月杀手》的故事发生于20世纪20年代。美国俄克拉荷马州奥色治族印第安人是当时世界最富有的人群之一，因为他们的居住地富藏石油。但很快，奥色治人一个接一个惨死，试图调查这些命案的人，也陆续被谋杀。眼见死者持续增加，新成立的FBI（联邦调查局）正式介入此案。

影片开始，豪横富绅孙兴文用极其残忍的手段灭鼠，家中开始怪事不断。老鼠吃了孙家小女的指甲，化作人形，以厉鬼样立于孙面前，引出铺天盖地的老鼠围攻他，密密麻麻场面可怖。孙家的事揭开了五仙之灰仙传说，众人为命悬一线的孙兴文进山，又道出村民所忌惮谈论的五仙庙被毁往事。随之，诡异怪相接踵而至，半夜出殡遇上脸色惨白的黄仙娶亲挡道，下聘礼掳走怀孕妻子，丈夫行踪不明，又有狐媚施展美人计，色胆包天的庸医来回鬼打墙逃路无门……一桩桩令人毛骨悚然的怪事围绕着山中众人，各种幻想欲望展露无余，心底埋藏的恶念被勾起，陈年凄厉往事渐渐浮出水面。在与世隔绝的深山老林，一行人呼救无门，周边的人又各怀心事，更有仿若妖仙现身设下迷局，令人窒息的惊悚感扑面而至。

这三个堂姐弟长在一个屋檐下，性格不同却都自带原生家庭的影响，这也左右着他们的人生。

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很明显，凶手就是在向警察发起挑衅。

新朋友艾普尔也前来协助他们扳倒一个神祕的犯罪集团，但是当对方派出一支变种军团，他们很快发现根本就是自不量力。